Desde 1997 hasta 2004, Thielemann fue Director Musical General en la alemana Ópera de Berlín. No sólo por las interpretaciones de todas las óperas de Richard Wagner en Bayreuth, sino también por el repertorio de Strauss, Thielemann figura hoy como uno de los directores más codiciados del mundo. Su repertorio operístico abarca desde Mozart a Schubert y Henze.
Christian Thielemann ha sido invitado a las óperas más prestigiosas del mundo tales como la Royal Opera House Covent Garden de Londres, la Metropolitan Opera de Nueva York, la Chicago Lyric Opera y la Vienna State Opera, donde en 2003 dirigió una nueva producción de “Tristán e Isolda”, una reposición de “Parsifal” en 2005, y también participó en un concierto en conmemoración del 50. Aniversario de la reapertura del teatro tras su destrucción en la 2ª Guerra Mundial.
Christian Thielemann debutó en el Festival de Bayreuth en el año 2000 con “Los Cantores de Nüremberg” de Wagner. En el año 2001 dirigió “Parsifal”, seguido de “Tannhäuser” de 2002 a 2005. En 2006 va a dirigir la nueva producción del Anillo.
Ha sido artista invitado habitual de la Filarmónica de Viena y la Filarmónica de Berlín, la Staatskapelle Dresden, la Koninklijk Concertgebouworkest de Ámsterdam, la Israel Philharmonic Orchestra y la Philarmonia Orchestra de Londres. En los Estados Unidos, ha colaborado con las orquestas de Nueva York, Filadelfia y Chicago. En el 2000 comenzó su cercana asociación a la Filarmónica de Viena. Su debut en la Vienna Musikverein fue grabada por la Deutsche Grammophon ( “” de Strauss, opus 64 y la “Rosenkavalier Suite”). En septiembre Sinfonía Alpina de 2002 dirigió la Filarmónica de Viena tanto en el Musikverein como en Londres, París y Dortmund. En el otoño de 2003, seguido de unos conciertos en Viena, viajó con la orquesta de gira por Japón. En el verano 2005, realizó la apertura del Festival de Salzburgo con la Filarmónica de Viena.
Christian Thielemann ha grabado las sinfonías completas de Robert Schumann con la Philarmonia Orchestra, así como la Quinta y la Séptima Sinfonía de Beethoven para Deutsche Grammophon, así como también ha grabado CDs de preludios y oberturas de Richard Wagner para el mismo sello junto a la Philadelphia Orchestra.
Cuatro grabaciones con la orquesta de la Opera de Berlín contienen oberturas y preludios de Hans Pfitzner y Richard Strauss, “Carmina Burana” de Carl Orff, “Pelleas y Melisande” de Schönberg, así como Cantatas de Beethoven. La misma compañía ha editado un CD de arias con Thomas Quasthoff y la Orquesta de la Ópera de Berlín. En 2003, el mismo sello también editaría un disco en directo con la Filarmónica de Viena interpretando “Ein Heldenleben” de Strauss, así como una grabación en directo de la interpretación en 2004 del “Tristán e Isolda” de Richard Wagner en la Vienna State Opera. A principios del 2005, la Deutsche Grammophon editó el concierto inaugural de Christian Thielemann, como nuevo Director Musical General de la Münchner Philharmoniker, ejecutando una versión en directo de la Quinta Sinfonía de Antón Bruckner.
El 20 de octubre de 2005, Christian Thielemann unió el Coro de Niños de la Catedral de Regensburg con la Münchner Philharmoniker en el primer concierto en honor al Papa Benedicto XVI en el Vaticano. El concierto tuvo una extensa cobertura por los medios y también fue editado a principios de noviembre en DVD.